而魏良卿在最后也向崇祯汇报了，他在杂交水稻上研究遇到挫败的事，虽说崇祯告诉了他三系杂交的法子，但是这一年来他跟着农科院的官吏在南方忙碌，也才刚刚弄明白什么叫自花授粉和异花受粉。
对于这种挫败，朱由检到并不失望，就算是袁隆平培育出杂交水稻，那也是建立在一百多年来的近代农业科技发展基础上取得的成果。在17世纪，关于植物学的知识，不管是东方还是西方都处于莽荒时代。
东西方对于植物学的认识，着重于它有什么用，如何才能培植它，这样诸如此类的实用性问题上。但是对于植物的发展和种属关系，尚处于一知半解的状态。
也许这时代人类最为了解的植物，大约就是小麦、水稻等农作物了。但是这种了解，也仅限于极为粗浅的表象。当然随着30年宗教战争的结束，怀疑自然秩序就是怀疑上帝，这种陈腐的天主教思想被新教徒们打倒撕破之后，基于海洋贸易基础上的自然科学迅速发展，使得欧洲在植物学上的认识开始远远甩开了东方。
魏良卿的失败汇报，只不过打破了崇祯的一点侥幸心理，让他明白没有基本的知识作为理论基础，想要走科学上的终南捷径，就跟让大象穿过针鼻一样困难。
“这并不算是失败，也许是朕过于急躁了，有些东西显然是不能一步登天的。朕看，科学院不如先把精力放在对水稻生长过程的研究上，我们总要对它有足够的了解，才能研究如何改进出更好的种类不是么？”朱由检思考了片刻，便对着有些惶恐的魏良卿安慰道。
魏良卿不明白崇祯说的是什么意思，农科院研究杂交水稻的人员，都是他亲自挑选出来的有经验的老农，也有熟悉农事的上林苑监官吏。这些人对于农事可谓相当熟悉，甚至于看一看水稻的长势，就能估算出亩产来。
难道在皇帝眼中，这些人还不够了解水稻的种植么？他正茫然的时候，朱由检似乎已经觉察到了他的不解，于是接着为他解释道：“朕说的了解，不仅仅是怎么去种植水稻。而是从另外的视角去研究它们。”
“另外的视角？” 魏良卿有些迷糊的问道。
朱由检思量了一下说道：“就好比大明的军队，以往朝廷只关注这只军队的统帅是谁，有多少名士兵，其中有多少青壮，一年要花多少钱粮。
但是朝廷从来没有去考虑过，这些士兵都叫什么名字，他们都来自什么地方，他们认识多少字，喜欢吃什么，又信仰什么宗教，他们之间有没有亲友同乡的关系，他们参军之前都做过什么，他们家中有几口人，如果他受伤或是死亡了，他的家人要依靠什么活下去等等之类的问题。
水稻也一样，你们不应当只关注它的产量和种植条件。还要分清楚水稻究竟有多少种类，它们之间是怎么发展到今天这么大区别的。简单的说，便是要研究它的形态、分类、生理、生态、分布、发生、遗传、进化等问题。
当然研究的对象未必只是水稻，但凡一切植物都可以作为研究对象，只有选择的研究对象越多，我们获得的信息量也就越大，才越有可能触类旁通…”
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