而黄台吉联络其他贝勒，逼迫大妃阿巴亥殉葬后，也断绝了阿巴亥以三个儿子的名义，联合起八旗最强大的一股力量。
努尔哈赤临死前把镶白旗旗主杜度调到镶红旗，准备以此旗给多尔衮。但是黄台吉继位后乘机夺取了镶白旗，以自己的长子豪格作为旗主。
不过多尔衮最终还是保住了所领的15牛录，并归附于长兄阿济格的正黄旗下。黄台吉又将正黄旗和镶黄旗改旗号为镶白旗和正白旗，而他所领的两白旗改成了两黄旗，从而确立了自己在八旗中的领导地位。
但是阿济格领镶白旗，多铎领正白旗，加上努尔哈赤遗留的亲军，成为八旗中实力最强的两旗。
接下来是代善父子领有的两红旗，其次是两蓝旗，最后才是黄台吉的两黄旗。
对于代善、阿敏、莽古尔泰来说，让实力最弱小的黄台吉接任大汗，才不会威胁到自己的地位。他们甚至于，还想继续削弱两白旗，瓜分完努尔哈赤留下的遗产。
但是带头逼死大妃阿巴亥的黄台吉，却表现出了一个政客的远见。他明知道自己已经和阿济格三兄弟结下了仇怨，却不准其他三贝勒继续打击削弱两白旗的力量。
黄台吉的行为，迅速安定了努尔哈赤去世后金国的政治局面，弥合了后金内部之间争夺汗位出现的裂痕，也形成了朝堂上政治力量的相对平衡。
虽然黄台吉对阿济格三兄弟有杀母夺位之恨，但是在现在的后金国内，能维护三兄弟生命财产的，却只有这位仇人。这不得不说，是一个极大的讽刺。
而同样，获得了兵力最为雄厚的两白旗的支持后，其余三大贝勒不得不对黄台吉表示了明面上的尊敬。黄台吉的地位开始高于其他三大贝勒，不再是刚刚登基时那个有名无实的大汗了。
去年末，黄台吉迫使其他三人同意，对八旗制度进行了一些变革。
如在八旗中各设一总管大臣，总管旗中一切事务，议政时与诸贝勒共坐同议。
总管大臣之下，每旗设佐管大臣二，负责佐理国政，审断狱讼，不令出兵驻防。
每旗再设两调遣大臣，出兵驻防，以时调遣，所属词讼，依旧审理。
这些变革政策，削弱了八旗旗主贝勒对于本旗的控制能力，把八旗部族军制转向了封建国家军队的变化，大大的提升了大汗对于八旗将士的影响能力。
不过黄台吉很清楚，他对于八旗制度的一切改革，都是建立在金国三面受敌的威胁处境之下。
为了能让金国生存下去，这些女真亲贵和八旗旗主们，才愿意让渡出一部分权力，放弃原先的生活方式。
一旦金国失去了外敌，那么以女真贵族们蒙昧好斗的天性，他们很快就会把敌对的目标放在女真内部，甚至于自己身上。
他也很清楚，在金国内部，除了他自己同那些汉人之外，没人会认为金国会击败大明入主中原。
不管是蒙古人还是女真人，他们所想要的，不过是打服了南朝，迫使南朝承认金国的存在，并同金国进行贸易。
但是黄台吉却对这些人嗤之以鼻，虽然他身为女真人，但是从小受到的却是完整的汉人教育。他的老师是父汗身边的头号军师，也是协助父汗筹划统一女真各部战略的第一功臣-龚正陆。
龚正陆是江浙人，习文不成，就改行做了商人，东西南北，到处漂泊，生意做得不是很好，却大长了阅历，士农工商三教九流，他无一不知。
在辽东经商时，被努尔哈赤的外祖父王杲所掳，成了王杲身边的一名算账先生。
就是这么一个学文不成，经商平平的读书人，成为了努尔哈赤的启蒙先生。他把自己从书中读到的军事道理教授给了努尔哈赤，让努尔哈赤从一个蛮族首领成长为了一个狡猾的异族军事领袖。
努尔哈赤不但自己学习这些汉人的文化，还把女真贵族子弟和自己的子侄都送到了他门下学习，如代善、汤古代、阿拜、莽古尔泰、阿巴太、塔拜、黄台吉等。
如果说刚开始，龚正陆只是为了能够试验自己的平生所学究竟有没有用处。那么之后，随着努尔哈赤的势力增长，他对于明国的勃勃野心也终于显露了出来。
龚正陆显然没想过，他所教导的蛮族学生，居然会以自己的故土家园作为目标。是以想要通过朝鲜，逃回中原去。
但是他的行动却最终被努尔哈赤所知道了，努尔哈赤毫不犹豫的处死了这个曾经作为师长和朋友的汉人。并从此把汉人中的读书人，都当做了不可靠的奸细。
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