黄河夺淮以后，淮河上中游来水，在黄水顶托下，泄流不畅，逐渐潴积于盱眙和古淮阴城之间，使得破釜塘、白水塘、富陵湖、泥墩湖、万家湖等陂塘和小湖连成一片，扩大为浩荡的洪泽湖。一旦洪水暴涨，黄、淮交并，又把繁华的古泗州城、明祖陵和沿湖的许多村落吞入湖底。
由于黄强淮弱，黄河常倒灌入湖。泥沙淤淀，湖底日高。加上朝廷为了维持南北运河的粮运畅通，在治理黄、淮、运的策略上，采取了蓄清刷黄、引淮济运的治水方法，因而不断延长加高原来防御淮河洪水的高家堰，使之成为现在的洪泽湖大堤，洪泽湖遂成为一个著名的“悬湖”。
“倒了高家堰，淮扬不见面。”这句顺口溜可不是开玩笑的，洪泽湖高屋建瓴的形势，对整个里下河地区构成了严重的威胁。为了防止发生大面积的睡在，从明成祖朱棣时期就开始，河道衙门就积极的疏通高邮湖和邵伯湖之间的通道，以引淮入江。然而，在正德年间，淮河洪水还是冲破蒋坝洪泽湖大堤，夺路入江，固定淮河由三河经扬州入江的流路。
事实上，黄河夺淮入海的严重后果，还不止洪泽湖一处。在淮河以北，由于黄河夺泗、夺淮，使沂水、泗水等迂回交侵，逐渐潴积形成骆马湖、黄墩湖。沂、泗洪水失去了入淮的流路，遂在骆马湖以下注入六塘河，经灌河口入海。
沭河下游则潴积成扎埠、平墩、青伊湖等串联湖泊洼地，从蔷薇河、临洪河分流入海。原淮河的入海口则形成新的黄河三角洲，海岸线从原来的云梯关附近向东延伸六十公里，成为现在的海岸线。
明代的淮安府，还没有今天的响水、滨海、射阳、大丰等城镇，海岸线靠近今天的盐城一带。正是因为黄河夺淮入海，带来了大量的泥沙淤积，逐渐的形成陆地，海岸线不断的向东扩展，最终才形成了今天的地图。根据测算，在明代以后，因为黄河夺淮入海，增加的土地面积，至少有两万平方公里以上。
黄河夺淮以后，水灾连年，严重损害了两淮农业经济的发展。由于泗水和淮河下游河床的淤高，黄河泄流不畅，连年决口，甚至改道。沂水、沭水、泗水等也因失去了入淮之路而随地漫流，演成水患，这使得水患的面积，扩展到了凤阳府等地。
“说凤阳，唱风阳，凤阳本是个好地方，自从出了个朱皇帝，十年倒有九年荒。”在这句耳熟能详的凤阳花鼓歌词的背后，其实就隐藏着大量的水患带来的悲惨景象。凤阳府一带，干旱的时候，粮食颗粒无收，下雨的时候，洪水泛滥，同样还是颗粒无收。
当地的百姓，反复遭受旱涝灾害的影响，实在是过不下去了，只好大量的外出逃荒，四处讨饭，同时将这段凤阳花鼓的歌词带到了全国。因为官府的治理河道不力，百姓们自然就将所有的罪过，都归咎到了朱元璋的头上。
对于凤阳府连年遭灾的情况，作为河道总督的曹文衡自然很清楚。根据河道衙门的统计，自从成祖迁都北京以后，淮河流域共发生两百五十多次较大水灾，平均下来，每年就有一次。
沂、沭、泗流域的洪灾，同样很严重，有明一代，已经发生一百八十多次较大水灾。洪水所到之处，淹没农田，吞噬村庄，甚至毁圯城郭。今灌南、涟水等临海县份，有时平地水深竟达一丈多深，连街市都能行船。
洪水泛滥的时候，淮河以南的里下河平原地区，“自正德以来，每淮水盛时，西风激浪，白波如山，淮扬数百里中，公私惶惶，莫敢安枕者，数百年矣。”可见洪灾的严重。
浊水的到处漫流，不仅使农业连年失收，广大人民生活贫困，而且破坏了这一地区原先优越的自然条件。很多水产资源丰富的湖泊和可资排灌的河流被淤为平陆，大片沃野被流沙礓砾掩盖下去。涟水境内，有的地方流沙淤积竟达两丈多深。由于黄河夺淮造成许多河流排水不畅，还使大片土地盐咸化，成为沙卤赤地。
泗水和淮河下游为黄河侵夺后，从两淮（淮阴、淮安）北上的漕运河道，实际上是由黄河北上。黄河的不断决溢改道，则使漕运河道随之不断改变。河身的不断淤高，又导致运河水量不足，岸窄水浅，不任重载。河道衙门每年都要耗费大量的人力物力财力，疏通河道，朝廷自然是深感窘迫，下面的人也是叫苦连天。
疏通河道是需要钱粮的，没有抢粮，什么都做不了。而明国朝廷，眼下最缺的就是钱粮。而且，治理河道，是需要调集大量的民夫的。几十万的民夫聚集在一起，那就是一个巨大的火药桶，随时都有爆炸的危险。一旦有火星掉进去，马上就会天下大乱。
明国的统治者，当然不会忘记元末的惨痛教训，因此，他们要求，每次调集的民夫，绝对不能超过五万人，以免引发无法控制的动乱。当然，现在没有这个限定了。陕西流寇动辄就是几十万甚至上百万，河道的几万民夫还算什么？
张准不动声色的问道：“曹大人的基本理念是什么？”
曹文衡谨慎的回答：“治淮必先治黄。”
张准若有所思的点点头，表示赞成曹文衡的理念。
曹文衡的想法的确没有错，要疏通运河，首先要做的事情，就是整治黄河。要根除淮河的水患，必须将黄河这条黄色的咆哮巨龙，死死的压住。堵不如疏，向来都是如此。
即使是到了后世，新中国也是按照这样的方法处理的，在黄河的上游，努力种植树木，减少泥沙的来源，也是花费了巨大的人力物力财力，才最终摁住黄河的。
只要摁住了黄河，淮河本身就轻松多了。淮河本身没有太多的泥沙，只要采取适当的措施，将河道的泥沙都冲刷走，淮河流域，就可以逐渐的恢复往日的富饶。没有了大量泥沙的淤积，洪泽湖也不会变成悬湖，对四周的威胁也就解除了。
张准谨慎的说道：“曹大人对于治黄，有什么想法？”
曹文衡缓缓的说道：“植树造林，退耕还林，打坝淤地，修筑梯田，四管齐下，百年大计。”
张准皱皱眉头，缓缓的说道：“那依曹大人的意思，彻底治理黄河，需要多少银子？”
曹文衡深沉的说道：“前期投入估计不会少于五百万两，以后每年至少还要耗费五十万两。”
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