观星接到消息后立刻和德丽莎合议文书向两国求援，同时尝试重启封印阵法，未能成功。接到使节消息的两国也分别派出双子作为援军将领，却在救援的路上碰到了以灰蛇为首的难民，因此被困山谷，使节也失去了和煌国的联系。
【一周目】
在一周目中，丽塔留下口信谎称战事稳定，让观星专心研究新的封印阵法，并把安全的后山留给城民避难，自己将祸斗引到危险的古战场正面对决。等观星赶到的时候，丽塔已经不幸牺牲。
失去了陪伴自己千年的贤臣，观星彻底黑化成魔王，认定另外两国作壁上观的她决定复仇。先是逼迫崩溃的德丽莎退位，自己接任圣贤王，又动用灭国大阵在三个月间迅速剿灭另外两国。
舰长回到海底祭坛的那天正好是七夕佳节，但原本熟悉的世界已经天翻地覆。在舰长的极度震惊中，观星让英雄王和海盗王互相厮杀，两败俱伤；自己也被灰蛇下毒，强撑着下完了七星残局，将三个月来发生的一切告知舰长后牺牲。
【二周目】
舰长启动了观星托付的小特，回到了二周目的三个月前。这次他引导观星先前往遗迹侦查，又碰到了逃难的城民，因此及时前往古战场支援，丽塔得以幸存。但通过遗迹吸收力量的祸斗即将因反噬而爆炸，危机之下舰长只能将其引入海水，自己则因能力限制而回到二周目的七夕。
祸斗的爆炸造成了极其严重的次生灾害：希克扎尔教国的雪山融化，耶梦加得联邦的海水蒸发；遭受毁灭性打击的两国将这次天灾和此前失踪的援军联系到一起，认定煌帝国祸水东引。
愤恨交加的两国结成联军，攻入护国大阵失效的煌月城下；丽塔奉命带领城民撤离，观星则在空城上抚琴拖延时间，最终力竭牺牲。舰长苏醒后，丽塔向他传达了一切，并将小特和有关使节的情报托付给他，三周目由此开启。
【三周目】
舰长在名单上发现了双子的名号，随后通过地图成功在两国交界处的山谷找到二人，顺便发现了能作为口粮的地瓜。了解事情原由的舰长将她们带回煌月城，和观星一起商量谈判的方案。
面对怒火中烧的海盗王和英雄王，观星提出用风能塔为希克扎尔排水，提供移动房屋给耶梦加得，开放国库保证两国的口粮，再加上舰长临时编造的凶兽穷奇，最终成功忽悠双王签下停战约定，故事暂时告一段落。
回到三周目七夕的舰长仍然心有余悸，但也渐渐沉浸在和平之中，没能意识到危机的接近。这次灰蛇以手艺人的身份登场，他将花灯中稳定的蜡烛内芯换成易爆的石烛，比普通的花灯亮的更久，因此广受欢迎。同时在千星阁内设下明显的爆炸物来让检查方麻痹大意，阴谋已经准备完成。
最终，舰长亲眼目睹了千星阁的爆炸，木质的街道疯狂燃烧，观星三人葬身火海。懊悔无比的他顶着大火回到观星房间，启动小特进入更加绝望的轮回。
【轮回】
在故事的前半段，舰长每次都是肉身穿越到之前的某个时间点，通过不同的行动来开辟新的未来。但在后半段中，存档点已经固定在七夕当天，舰长只能让意识回溯到和观星约会的时候，不停的经受拯救和失败。
四周目，舰长和丽塔破解了花灯的秘密，也抓到了手艺人身份的灰蛇，但观星被另一名伪装成影卫的灰蛇杀死；五周目，三人合力击败手艺人和影卫，观星更衣的马车却因爆炸而失控，舰长最终在城外找到了她的遗体；六周目，观星为救舰长被压在废墟之下；七周目，观星在舰长的怀中被暗箭射中……
【终局】
数不清多少次轮回后，近乎崩溃的舰长向观星坦白自己经历的一切，小特也因轮回达到阈值而苏醒，揭晓事情的来龙去脉。了解到真相的舰长和观星决定利用小特的增幅机能离开这个世界。和正在小憩的丽塔告别后，观星登上了休伯利安，星与你消失之日到此结束。
未来的某一天，舰长将通过意识映射前往千年之前的煌帝国，重新修正崩坏国记零的历史，并在故事的最后留下小特。但他也希望过去的自己能走出不一样的道路，因此给小特设置了极高的阈值，等待千年之后，星与你消失之日的再次到来。
…………………………
‘徐凡’在这里的剧情就是第一幕，封印祸斗的事情。
因为舰长这一角色本来就代表的是玩家，所以就没加入，而用‘徐凡’代替了。
经过大同小异的剧情，外加‘徐凡’模糊不清的目的与额外的照顾，和观星有了点感情。
观星等待千年还没进行第二幕剧情就被召唤到现实了。
……………………………………
作为暗线的德尔塔过去相对来说就短得多。她似乎来自某个奇怪的平行世界，可可利亚成为了军队的元帅，孤儿院的孩子们大多都成了士兵，但希儿和布洛妮娅并没有出现，反而保留了伊莎贝拉等只活在回忆中的角色。
但理论上来说，可可利亚的主要活动范围应该是俄罗斯，元帅和上尉也是苏联常用的军阶，可这里的地点却是圣芙蕾雅市，按主世界来算应该在极东地区，不知道是bug还是故意的架空设定。
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